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支持天坛医院临床资源的深度运用

项目背景

2016年,中国精准医疗计划正式启动,旨在应用现代遗传技术、分子影像技术、生物信息技术,结合患者生活环境和临床数据,筹建中国人群全基因组数据库和样本库,实现精准的疾病分类和诊断,并能够制定具有个性化和针对性的预防治疗方案。

首都医科大学附属北京天坛医院是世界三大神经外科研究中心之一、亚洲神经外科临床、科研、教学基地。天坛医院脑神经领域在世界享有盛名,率先启动了脑血管病精准医学的研究,包括脑血管病精准医学队列、脑血管病发病和预后的组学研究、脑血管病药物基因组研究及脑血管大数据研究等。为了满足前沿科研的计算模型需求,天坛医院启动了面向高通量基因组学数据处理与智能病理影像识别系统建设(以下简称:基因组学系统)。

用户需求

天坛医院基因组学系统将用于临床实验与研究中心诊疗信息、组学数据及高分辨影像数据的存储、处理和运算;神经系统单基因病诊断中心每年三千例患者DNA检测数据的处理和分析。为国家神经系统疾病临床医学研究中心提供数据分析,满足医学数据智能辅助诊断系统和全国性组学数据库建设需求。

基于基因组学系统的建设目标,存储系统具备较高的聚合读写带宽,为基因组测序等应用提供100G以上的高速存储网络,满足基因数据处理与运算需求;精细化的权限管理功能,可向国家中心提供数据管理服务,同时提供可视化界面,方便用户的配额管理;临床数据作为该中心的核心数据,价值极高,要求存储系统具备高可靠性,以保障数据安全。

解决方案

曙光公司凭借多年在生物基因领域积累的经验,打造生物基因行业云存储解决方案。曙光ParaStor分布式存储系统作为该系统的存储资源。曙光ParaStor聚合带宽40GB/s以上,100Gb/s EDR Infiniband高速存储网络,解决生物基因应用中对海量大文件存储场景高聚合带宽、小文件存储场景高IOPS的存储需求。

此外,ParaStor面向云桌面系统提供10Gb/s 以太网存储网络,保证生物数据的高效共享。ParaStor系统支持NIS,Microsoft Active Directory,LDAP等权限管理功能,可以与用户原有权限管理系统整合,保障数据共享过程中全程掌控。支持5种不同的配额类型,并提供便捷的配额管理界面,方便用户配额分配。

基因研究产生的数据速度增长极快,曙光公司ParaStor分布式存储系统可通过性能与容量的线性增长,满足对存储系统数据处理能力和扩展性的要求。

ParaStor分布式存储系统通过多种技术手段,从物理底层到逻辑层全方位保证存储系统高可靠性和高可用性,为临床数据的存储、管理、应用和共享保驾护航。

客户收益

在曙光公司的帮助下,天坛医院完成了基因组学系统建设,为“临床资源深度分析、挖掘和共享”提供了可靠的技术保障,也为医学数据智能辅助诊断系统和全国性组学数据库的建设奠定了坚实的基础。

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